本中心主要研究方向包括国家公园制度伦理与制度设计（国家公园制度与政策）、国家公园游憩利用与资源保育（国家公园资源保护与利用）和国家公园社区参与及社区建设。各研究方向的主要研究内容如下：

    1.国家公园制度伦理与制度设计

国家公园及其制度建设是一个非常复杂的系统工程，涉及众多利益相关者责权利的调整。国家公园管理模式作为自然管理制度，是人们从生态角度评价对大自然的道德关怀及其哲学反思之中所做出的政治决策。因此，本研究中心的首要任务是，通过制度建设解决自然遗产资源管理中现存的各种矛盾和问题，为国土空间开发保护和主体功能区建设提供制度支持。该研究方向包括国家公园的发展史、自然管理哲学问题、制度伦理、设置标准（含规划、保护利用技术等标准）、管理规范、管理体制与机制、台湾国家公园管理制度评价研究、闽台国家公园管理制度对比研究等。

 2.国家公园游憩利用与资源保育

资源保护和游憩利用是国家公园规划和管理的两大目标。只要有利用，资源必然有损害，有变异，关键是这种变化是否在可接受的范围之内。要取得平衡，这两个目标都必须妥协，因此如何协调利用与保护的矛盾也是研究的内容。该研究方向的内容包括主导性目标的确立以及为主导性目标制定可允许改变的标准、游憩利用的方式与内容、游憩利用与环境的关系、游憩利用与经济发展的关系、游憩利用的品质保障以及限制游憩利用的范围、资源与环境管理、资源与环境保育技术、台湾地区国家公园游憩利用与资源保育对福建的启示、中国参与全球自然遗产的利用和保育的新机制等。

 3.国家公园社区参与及社区建设

自然遗产地周边社区是国家公园建设过程中一个不可回避的涉及区域，一旦某区域被划定为国家公园, 其内的资源就要被保护起来，而这将会对长久居住在该区域内部及周围且依赖划定区域内的资源而生存的人们产生很大的影响。过去遗产地社区发展问题被忽视或处理不当，导致了我国现有各种公园建设过程中的许多矛盾和冲突。本研究中心将社区问题列为国家公园建设的主要研究方向之一，正是要直面并寻求社区参与保护和原住居民生计等问题的解决之道。该研究方向包括利益相关者义利分配问题、社区居民生计、社区参与、社区社会与经济发展、社区生态文化建设等问题。

除此之外，中心肩负服务地方发展的研究任务，即国家公园相关的服务地方工作。该项工作的业务范围为：面向三明及其周边区域的国家级和世界级的各类公园、遗产地、自然保护区、风景名胜区、水利风景区、旅游景区等单位，提供项目咨询、规划、培训、营销、经营、管理等服务。